سوالات (ژنتیک)

[پیمان هادی فرکوش]

دوستان میشه برام توضیح بدین که ماهواره ها چی هستن خدا خیرش بده استادمون کلی در مورد کاربردش تو انگشت نگاری dnaو انواع ماهواره ها توضیح داده آخرش ما نفهمیدیم اصن ماهواره چی هست کجا هست؟
دمتون گرم

توالي‌‌هاي تكرار شونده براساس واحد تكرار:
الف : ماهواره ها يا satellite
ساتلايت DNA براي اولين بار درسال1960 كشف گرديد و مشخص شد كه از چند تا چند صد جفت نوكلوتيد را در بر مي‌گيرد. پژوهشگران فهميدند وقتي DNA را تحت شرايط خاص سانتريفوژ مي‌كنند 2 يا تعداد بيشتري لايه رسوب مي‌كند كه يك باند حاوي ژنها است و باند بعدي باند ساتلايت است كه حاوي قطعاتتكراري DNA بسيار بلندند.
ب: ماهواره هاي متوسط يا mini satellite
ج: ريزماهواره ها يا micro satellite



اکثراً DNA تکراری انسان که رمز گذاری نمی کند اغلب در ردیفها یا قطعاتی از تکرار های پشت سر هم از یک توالی است که ممکن است ساده باشد (1 تا 10 نوکلئوتید ) یا به طور متوسط یک توالی پیچیده باشد (دهها تا صدها نوکلئوتید ) . ردیفها (آرایش های ) منحصر به فرد می توانند در تعداد کمی یا تعداد زیادی موقعیت کروموزومی مختلف اتفاق بیافتد . بر طبق اندازه ی ردیف سه زیر گروه اصلی می تواند تعیین شود :
1 – ِDNA ماهواره (ساتلیت)
2 – DNA مینی ساتلیت
3 – DNA میکرو ساتلیت .
DNA ساتلیت از نظر رونوشت برداری غیر فعال است که اکثریت آن از DNA مینی ساتلیت است اما در مورد DNAمیکرو ساتلیت یک درصد مهم (گر چه خیلی کوچک ) درDNA کد کننده قرار گرفته است.
DNA ما هواره: شامل ردیف های بسیار طولانی از تکرار های پشت سر هم است و می تواند از حجم DNA به وسیله ی سانتریفوگاسیون گرادیان چگالی جدا شود. DNA ماهواره ی انسان
از ردیف های بسیا طولانی از DNA تکراری پشت سر هم تشکیل شده است. واحد تکرار ممکن است یک توالی ساده باشد (فقط تعداد کمی نوکلئوتید طول داشته باشد.) یا بطور متوسط یک توالی پیچیده باشد.
DNA ماهواره بیشترین نواحی هتروکروماتینی از ژنوم را تشکیل می دهد و به طور قابل ملاحظه در نزدیکی سانترومر ها ، یافت می شود (هتروکروماتین نزدیک سانترومری( زمانی که واحد تکرار خیلی کوچک است ترکیب اساسی واحد های تکرار و بنابراین ترکیب اساسی کلی DNAماهواره ممکن است به طور واقعی از DNA ژنومی کلی ، متفاوت شود . به عنوان یک نتیجه 3 DNA ماهواره ی انسان ، ماهواره های 1و2و3 قادرند که از توده ی DNA به وسیله ی سانتریفوگاسیون گرادیان چگالی شناور جدا شوند . هر کلاس ماهواره ، تعدادی از خانواده های توالی DNA تکراری پشت سر هم مختلف را شامل می شود (زیر خانواده های ماهواره ) که تعدادی از اینها بین کلاس های مختلف تقسیم شده اند . ماهواره های 2و3 اکثراً تکرار های توالی ساده را شامل می شود اما ساختار با ترتیب بیشتر همچنین آشکار است .


از آنجا كه تعداد ماهواره هاي كوچك از هر شخص به شخص ديگر به طور قابل ملاحظه اي متغير است و هر شخص 100-50 نوع ماهواره كوچك متفاوت از ديگران دارد، شانس يكسان بودن ماهواره هاي كوچك در دو فرد به جز در دو قلوهاي يكسان بسيار ناچيز است و از اين اصـول در پـزشكي قانوني جهت شناسايي مجرم استفاده مي شود. به اين ترتيب كه نمونه‌هاي حاوي سلول از محل جنايت به آزمايشگاه منتقل شده و پس از آناليز DNA ، آن را با نمونه‌هاي آناليز DNA كه از خون افراد مظنون به دست آمده است مقايسه كرده و درصورت يكسان بودن فرد مجرم شناسايي مي شود.

[gene]

دوستان ميدونين چگونه پرايمر طراحي ميكنن،من نياز به طراحي يه پرايمر دارم كسي ميتونه كمكم كنه ،يا اينكه يه پروتئين رو بلاست كنيم و درخت فيلوژنتيكي رسم كنيم
از اين دوسوال يكي رو جواب بدين استاد 5 نمره امتحان پايان ترم رو با اين ميدن
دوستان منتظرم

[heavenly]

سلام دوست من
سوال اول شما:
برای طراحی پرایمر به توالی ژن مورد نظر نیاز داریم که توالی ژن از پایگاه ncbi قابل استخراجه. برای اینکه ژن تکثیر شه نیاز به دو پرایمر فوروارد (مستقیم) و ریورس (معکوس) داریم که بهتره از ابتدا و انتهای ژن باشه و مکمل توالی ژن ما

[gene]

گفتن كه توالي دلخواه باشه ،واينكه كجا طراحي كنم؟
سوال دوم هم جواب ميدين

[heavenly]

اما جواب سوال دوم شما:
اگر توالی پروتئینی دارین و میخاین توالی پروتئینی مشابه آن را پیدا کنیم با بلاست کردن میتونیم این کارو انجام بدیم که به دو صورته
1-توالی یک پروتئین را با یک پایگاه اطلاعاتی پروتئینی مقایسه می کنه
2-توالی یک پروتئین را با یک پایگاه اطلاعاتی نوکلئوتیدی مقایسه می کنه

[heavenly]

گفتن كه توالي دلخواه باشه ،واينكه كجا طراحي كنم؟
سوال دوم هم جواب ميدين

منظورتون از توالی دلخواه چیه؟ یعنی توالی ژن رو نمیدونیم؟

[gene]

نه ،گفتن هرچي باشه مهم نيست فقط يه پرايمر طراحي كنيد و بياريد.

[heavenly]

نه ،گفتن هرچي باشه مهم نيست فقط يه پرايمر طراحي كنيد و بياريد.

خب یعنی یه ژن دلخواه از خودتون انتخاب کنین و پرایمر اونو طراحی کنین؟؟

[gene]

اما جواب سوال دوم شما:
اگر توالی پروتئینی دارین و میخاین توالی پروتئینی مشابه آن را پیدا کنیم با بلاست کردن میتونیم این کارو انجام بدیم که به دو صورته
1-توالی یک پروتئین را با یک پایگاه اطلاعاتی پروتئینی مقایسه می کنه
2-توالی یک پروتئین را با یک پایگاه اطلاعاتی نوکلئوتیدی مقایسه می کنه

اينم گفتن كه يه پروتئين رو انتخاب كنيد بازم به دلخواه هرچي باشه و بلاست كنيد باپروتئين يه موجود ديگه و درخت فيلوژنتيكي براش بكشيد ،فكر كنم دومي رو ميخواد

[gene]

خب یعنی یه ژن دلخواه از خودتون انتخاب کنین و پرایمر اونو طراحی کنین؟؟

آخه من نمي تونم شما ميتونين اينكارو بكنيد ،نمي دونم چطور و كجا طراحي ميكنن